Keeper:
1. Jerzy Dudek
21. Edwin Zoetebier
26. Ronald Graafland (eigen jeugd)
Verdediging:
2. Christian Gyan
3. Fernando Picun (10 februari 1999, verhuurd aan Defensor)
4. Bernard Schuiteman (21 november 1998, verhuurd aan FC Utrecht)
5. Jean Paul van Gastel 
8. Kees van Wonderen
15. Patricio Graff
16. Bert Konterman (1 juli 1998, gekocht van Willem II)
20. Ferry de Haan (eigen jeugd)
22. Ulrich van Gobbel
23. Henk Fräser
25. Patrick Allotey
27. René Bot (27 februari 1999, verhuurd aan de Graafschap)
31. Fernando Pascale (eigen jeugd)
Middenveld:
6. Paul Bosvelt
10. Jon Dahl Tomasson (1 juli 1998, gekocht van Newcastle United)
13. Tininho (1 juli 1998, transfervrij van Portuguesa)
17. Patrick Paauwe (23 juli 1998, gekocht van Fortuna Sittard)
28. René van Dieren (eigen jeugd)
Aanval:
7. Bonaventure Kalou
9. Julio Ricardo Cruz
11. Henk Vos 
14. Peter van Vossen (7 juli 1998, transfervrij van Glasgow Rangers)
18. Igor Korneev
19. Pablo Sánchez (15 januari 1999, verhuurd aan Deportivo Alaves)
24. Robin Nelisse
29. Brian Pinas (1 juli 1998, transfervrij van Newcastle United)
30. Ellery Cairo (25 februari 1999, was verhuurd aan Excelsior)